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FC:厦门大学张静和张勇采用多光谱法结合分子对接研究羟基化多环芳烃与过氧化氢酶的分子相互作用

阅读量:3858056 2019-10-27


文献分享
编者按:
2019年10月21日,厦门大学张静博士和张勇教授在Food Chemistry(2区,IF:5.399)发表了题为“Study on the molecular interactions of hydroxylated polycyclic aromatic hydrocarbons with catalase using multi-spectral methods combined with molecular docking”的研究文章。该研究为了揭示羟基化多环芳香烃(OH-PAHs)对过氧化氢酶(CAT)的潜在影响,采用多光谱和分子对接技术对CAT与1-羟基萘(1-OHNap),9-羟基菲(9-OHPhe)和1-羟基芘(1-OHPyr)的相互作用进行了研究。
虽然作者是从事环境领域,但这篇文章所采用的多光谱和分子对接的研究羟基化多环芳香烃(OH-PAHs)与过氧化氢酶的思路值得食品领域研究分子相互作用借鉴。
从目前最新发表的文献来看,已经陆续涌现出许多谱学结合分子动力学模拟,以及多谱学结合分子对接等研究分子相互作用的文章,有意愿采用分子对接或分子动力学模拟的研究者需要“心动不如行动”。
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科学私享
2019.10.27

第一作者:张静
通讯作者:张勇
通讯单位:厦门大学
DOI:10.1016/j.foodchem.2019.125743
文章概述
为了揭示羟基化多环芳香烃(OH-PAHs)对过氧化氢酶(CAT)的潜在影响,使用多光谱和分子对接技术对CAT与1-羟基萘(1-OHNap),9-羟基菲(9-OHPhe)和1-羟基芘(1-OHPyr)的相互作用进行了研究。荧光分析表明,1-OHNap,9-OHPhe和1-OHPyr可与CAT形成1:1比例的复合物,结合常数分别为6.31×10 3,1.03×10 4和2.96×10 5 L mol-1-1(17 ℃)。热力学和对接参数表明范德华力,氢键和疏水相互作用主导了三个结合过程。分子对接还揭示了OH-PAH与CAT的特异性结合方式。同步荧光和圆二光谱结果表明,三种OH-PAHs引起CAT的结构变化。此外,9-OHPhe促进CAT活性,但1-OHNap或1-OHPyr抑制其活性。在OH-PAHs的最大实验浓度下,由1-OHNap,9-OHPhe和1-OHPyr诱导的CAT活性变化百分比分别为8.42%,4.26%和13.21%。
文章结构

图文赏析
▲图1 各种浓度的1-OHNap(A),9-OHPhe(B)和1 OHPyr(C)下在17?C(pH = 7.40)时CAT的荧光猝灭光谱。
▲图2 三种OH-PAH与CAT的结合方式。CAT中1-OHNap(A),9-OHPhe(C)和1-OHPyr(E)的结合位点; 1-OHNap(B),9-OHPhe(D)和1-OHPyr(F)与周围氨基酸残基的结合力的详细说明
▲图3  1-OHNap-CAT(A),9-OHPhe-CAT(B)和1-OHPyr-CAT(C)系统在17?C(pH = 7.40)时的同步荧光光谱。
▲图4. 不同浓度的1-OHNap,9-OHPhe和1-OHPyr对17?C(pH = 7.40)时CAT活性的影响。
资助说明
本研究得到国家重大科学仪器发展项目[21627814],国家自然科学基金[21577110],福建省自然科学基金[2018J05024]和福建省中青年教师教育科研项目[JAT170841]资助
文章链接

学者简介
 
张静
张静,厦门大学嘉庚学院环境科学与工程学院专任教师,副教授,博士
● 教育背景:
2011.09 - 2016.09厦门大学,环境科学专业,硕博连读,理学博士学位
2007.09 - 2011.07河南师范大学,环境工程专业,工学学士学位
● 工作经历:
2017.02-至今:厦门大学嘉庚学院,副教授
● 研究方向:
环境化学、光谱分析、污染物降解处理、环境毒理与人体健康效应
资料来源
http://ese.xujc.com/2017/0320/c3545a58994/page.htm
 
张勇
张勇,博士,厦门大学环境与生态学院,教授。
● 个人简历
-厦门大学副教授(1995-1999)
-香港城市大学生物与化学系高级访问学者(1996-1997)
-厦门大学教授(1999-)
-韩国海洋与发展研究院访问科学家(2000-2001)
-澳大利亚阳光海岸大学高级访问学者(2002)
● 研究方向
1. 环境科学;环境化学;环境分析化学;分子发光分析;环境监测;
2. 海洋环境科学;典型有机污染物在红树林生态系统中的环境行为及其生态毒理效应;海洋环境监测资料
资料来源:
http://cee.xmu.edu.cn/faculty/zhang-yong-yong-zhang
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